Artenbestimmung/ barcoding

DNA barcoding
DNA barcoding is a method for characterizing or identifying species of organisms due to their DNA. For animal identification a 648 bp fragment of the cytochrome c oxidase subunit I gene is amplified by PCR and sequenced. Comparision of the sequence with data bases leads to species identification. The advantage of this method is that a part or even a tiny piece of tissue is sufficient for the classification - for example to analyse the diet of an animal. The laboratory has already experience with tissues of insects, bats and land plants - but also other organisms could be identified, dependent on availability of sequence data of defined samples.

Artenbestimmung
Eine Art kann bereits an Hand von kleinsten Gewebeproben durch DNA-Analyse bestimmt werden: hierzu wird ein 650-bp-Fragment aus dem Gen für die Untereinheit I der Cytochrom-C-Oxidase in der mitochondrialen DNA amplifiziert, sequenziert und mit den Sequenzen in der Datenbank verglichen. Bisher sind bereits die Sequenzen von über 69.000 Arten in der BOLD- (Barcode of Life Data )- Datenbank vorhanden (www.boldsystems.org, www.bolinfonet.org). Besonders vorteilhaft ist diese Methode zur Artenbestimmung bei Insekten (z. B. auch für landwirtschaftliche und forensische Zwecke) und Pilzen.

Leistungen des Labors: Isolation der DNA, gegebenenfalls Literaturrecherche, Genus- bzw. Species-spezifische Optimierung der Primer, PCR, Sequenzierung, Abgleich der Sequenzen mit Datenbanken